Asociacijos misija yra skatinti valstybės institucijas, privačias įmones ir kibernetinio saugumo bendruomenes tapti partneriais, nuolat besidalijančiais kibernetinio saugumo patirtimi, žiniomis bei gerosiomis praktikomis, taip kuriant brandžią kibernetinio saugumo raštingumo kultūrą ir saugesnę kibernetinę erdvę Lietuvoje.
KSEA siekia būti pažangia, profesionalia organizacija ir sudaryti sąlygas aktyviam narių įsitraukimui bei tobulėjimui savo srityje. Asociacija siekia prisidėti teikdama rekomendacijas, konsultuodama kibernetinio saugumo klausimais, organizuodama renginius, įskaitant konferencijas, seminarus ir dirbtuves. Pasitelkdami geriausias praktikas, įrankius ir ekspertinių žinių resursus galime padėti efektyviai minimizuoti kibernetinio saugumo rizikas bei suvaldyti kylančias grėsmes.